La Maison de la Nature axe l’essentiel de ses actions de sensibilisation en direction du public enfant. Dans un contexte d'augmentation rapide des problèmes environnementaux, il est en effet primordial de sensibiliser l’enfant à la richesse du monde qui l’entoure et aux menaces qui pèsent aujourd’hui sur la planète.

La plupart des interventions s’étalent sur deux ou trois séances, parfois six ou sept dans le cas d’accompagnement de projets. Elles se déroulent en classe ou dans des milieux naturels proches de l’école. La pratique du terrain est privilégiée autant que possible.

Les classes sont parfois associées à des inventaires scientifiques. Un premier projet, en lien avec le Conservatoire Botanique de Franche-Comté, a ainsi permis aux classes franc-comtoises de répertorier les sites à jonquilles sauvages. Un deuxième projet, en collaboration avec la LPO de Franche-Comté, a permis aux classes de participer à un recensement des sites de nidifications des hirondelles de fenêtre.

Les animations qui sont menées s’insèrent dans le cadre de politiques environnementales mises en place par les collectivités (politique d’élimination des déchets, politique de préservation de la ressource en eau…). De ce fait, elles sont généralement gratuites ou d’un coût très faible pour les écoles.

Les animations sont conduites en étroite relation avec l’Inspection d’Académie.